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水質檢測項目主要包括色度，濁度，嗅和味，懸浮物，溶解氧，溶解固形物，電導率，PH，總堿度，酚酞堿度，全硬度，化學需氧量，生物需氧量，含油量，氯化物，硫酸根，亞硫酸，磷酸根，硝酸根，亞硝酸根，硫化物，氟離子，溴離子，氨氮，六價鉻，鈉，鉀，鈣，鎂，鐵，銅等等。
（一）水質的物理指標
水體環境的物理指標項 目頗多，包括 水溫、滲透壓、混濁度（透明度）、色度、懸浮固體、蒸發殘渣以及其它感官指標如味覺、嗅覺屬性等等。
1． 溫度 溫度是最常用的物理 指標 之一。由于水的許多物理特性、水中進行的化學過程和生物過程 都同 溫度有關，所以它經 常是必須加以測定的。天然水的溫度因水源的不同而異.地表水的溫度與季節氣候條件有關，其變化范圍大約在0.1--30℃;地下水的溫度則比較穩定，一般變化于8--12℃左右，而海水的溫度變化范圍為-2--30℃。
2．嗅與味 被污染的水體往往具有不正常的氣味，用鼻聞到的稱為嗅，口嘗到的稱為味。有時嗅與味 不能截然分開。常常根據水的氣味，可以推測水中所含雜質和有害成分。水中的嗅與味的來 源可能有：水生植物或微生物的繁殖和衰亡；有機物的腐敗分解；溶解氣體H2S等；溶解的礦物鹽或混入的泥土；工業廢水中的各種雜質如 石油、酚等；飲用水消毒過程的余氯等。
3．顏色與色度 天然水經常表現出各種顏色。湖沼水常有黃褐色、或黃綠色， 這往往是由腐殖質造成的。水 中懸浮泥沙和不溶解 的礦物質也長帶有顏色，例如粘土使水呈黃色；鐵的氧化物使水呈黃褐色； 硫化氫氧化析出的硫使水呈藍色等等。各種水藻如球藻、硅藻等的繁殖使水 呈黃綠色、褐色等。
4．混濁度與透明度 水中若含有懸浮及膠體狀態的物質，常會發生混濁現象。地表水的混濁是由泥沙、粘土、有機物造成的。
5．固體含量 天然水體中所含物質大部分屬于固體物質，經常有必要測定其含量作為直接的水質指標。
二）水質化學指標
利用化學反應、生物化學的反應及物理化學的原理測定的水質指標，總稱為化學指標。由于化學組成的復雜性，通常選擇適當的化學特性進行檢查或作定性、定量的分析。根據不同的分析方法可以把化學指標歸納如下：
1．中和的方法 包括水體的堿度、酸度等；
2．生成螯合物的方法 如Ca2+ Mg2+及硬度等；
3．加熱和氧化劑分解法 將含生物體在內的有機化合物的含量以加熱分解時產生CO2的量[總有機碳（TOC）；微粒有機碳（POC）]、分解時消耗的氧量[總耗氧量（TOD）]或消耗氧化的量[化學耗氧量（COD）]來表示的指標；
4．生物化學反應的方法論 以生物化學耗氧量（BOD）為代表，是測定微生物分解有機物時所需消耗的氧量，包括測定微生物在呼吸過程中產生的CO2的量以及利用脫氫酶等酶活性法來測定有效生物量等指標；
5．氧化還原反應及沉淀法。最典型為溶解氧含量及氯離子含量等指標。
6．電化學法。有水的電導率，氯化-還原電位（pE）以及包括pH在內的離子選擇電極的各種指標，如F-、NH4+以及許多金屬離子；
7．微量成分。以儀器分析為主要檢測手段。包括分光光度法，原子吸收光譜法，氣相、液相色譜法，中子活化分析法以及等離子發射光譜法等。指標項目眾多，如生物營養元素、各種化學形態的重金屬離子及非金屬微量元素、微量有機物、水已的污染物（如有機農藥、油類）以及放射性元素等等。
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